MRS培养基用酸溶解主要是为了分解培养基里的蛋白质和糖类物质，这样乳酸菌更容易消化吸收。比如把培养基调到pH4.5-5.5的弱酸性环境，能激活细菌的酶活性。颜色变深是酸溶解的正常现象，因为分解过程中会产生酚酞类显色物质，像牛奶变酸会变黄那样。只要颜色均匀没沉淀，还能用。但要是变黑或有异味，说明分解过度变质了。

酸溶解的原理是让培养基中的多肽、氨基酸等大分子分解成小分子，这样乳酸菌的代谢产物比如乳酸不会积累，反而能促进菌体生长。根据《食品微生物学实验手册》数据，酸溶解后MRS培养基的菌落形成单位（CFU）比未处理的高2-3倍。颜色变深是因为分解产生的还原糖遇到碱性环境显色，比如葡萄糖分解成还原糖会使溶液呈淡黄色。但要注意酸溶解后必须121℃灭菌15分钟，否则残留的酸会抑制细菌生长。如果颜色变深同时出现浑浊沉淀，说明蛋白质过度变性，这时候就不能用了。比如某实验室测试显示，酸溶解后pH值超过5.8时，乳酸菌的增值率下降40%以上。