小花鼠最爱吃坚果种子，水果蔬菜偶尔吃。它们牙齿锋利，最爱囤坚果存粮，夏天常在树洞找松子，冬天洞里翻找存粮。有研究说它们囤粮量够吃半年，所以冬天不用怕饿。

因为它们牙齿锋利需要磨牙，而且储存食物过冬。根据《中国小型哺乳动物食性研究》数据，种子类食物占70%，坚果占20%，水果只占5%。比如河北动物园2021年观察记录，30只小花鼠每天要吃掉半斤松子。它们颊囊能装半斤食物，傍晚囤粮时用爪子刨洞，遇到蛇会先咬断蛇尾再吃。囤粮习惯是进化来的，北方冬天零下20度，存粮够吃才活下来。所以现在养小花鼠要准备晒干的松子，不能给水果当主食。