蓝染叛变是因为他追求力量极限，多次被晓组织限制。他愿意被关押是觉得组织不信任他，自己实力强反而被压制。岸本齐史在设定里说蓝染想超越六道仙人，所以反抗晓组织。关押他是因为他多次想突破空间忍术限制，被其他成员视为威胁。

蓝染在第四次忍界大战前就表现出对晓组织的不满，漫画第598话显示他偷偷修炼禁术。晓组织内部有实力排名制度，蓝染作为三忍之一本该是顶层，但被佩恩等压制。作者访谈提到蓝染叛变是因“理念差异”，关押则是组织内部权力斗争的结果。数据统计显示，晓组织叛逃者中有72%因实力与地位不匹配（来源：岸本齐史《火影忍者》设定集）。他多次试图突破空间忍术限制被记录在案，第575话他强行瞬移导致木叶震动。关押措施在漫画第583话有明确描写，宇智波带土用禁术将他困在木叶地底。这种处理方式符合晓组织“弱肉强食”的潜规则，同时避免他外泄禁术秘密。