跑胶主要是为了把DNA片段按长度排队对测序仪有个好下手机会就像用筛子把不同大小的豆子分开放跑胶时DNA会变弯曲在凝胶里慢慢走短链走快短链走慢长链走慢这样在跑胶图上就能看到从上到下越来越短的条带测序仪就是根据这些条带来读DNA顺序的

为什么得用跑胶这个步骤呢首先因为DNA片段长短不一直接混在一起测序仪根本分不清谁是谁跑胶就像给DNA排长队每轮跑胶要花2-3小时但能提高5%-10%的测序准确率毕竟条带越清晰读错碱基的概率就越低有研究显示不跑胶的样本有30%可能出现碱基误读问题而且跑胶还能帮我们检查DNA有没有断裂或者污染跑胶图上出现模糊条带就能及时发现问题调整实验流程再说了现在用的毛细管电泳跑胶技术比传统胶片跑胶快了3倍成本也降了40%这样既省时间又省钱还能保证测序质量你说跑胶是不是特别重要呢