合作市属于甘肃省甘南藏族自治州，是州府所在地，位于甘肃南部靠青海四川交界处。

因为甘南州是甘肃省13个市州之一，合作市作为全州政治经济中心，2014年才从玛曲县分出来设市，所以现在正式划归甘南州管辖。数据显示甘南州总面积2.9万平方公里，人口约68万，合作市位于东经34°22′-36°12′，北纬33°16′-35°34′之间，距离兰州300公里，距离青海同仁县80公里，距离四川若尔盖县150公里。根据2020年第七次人口普查，合作市常住人口14.3万，是甘南州唯一一个藏语人口过半的县级市。这种地理布局既考虑到民族区域自治，又便于交通枢纽建设，所以合作市现在明确属于甘南州。不过要注意有些老地图可能还标注为玛曲县，这是行政区划调整前的遗留问题。