GC含量高的基因组在变温分析中需要更高温度，因为GC碱基对之间氢键多，耐高温能力更强。就像煮饺子要水开才能下锅，GC多的DNA在低温下容易解开结构，必须加热到60℃以上才能保持双螺旋稳定。比如人类基因组GC含量约40%，在55℃就能保持完整，而某些海洋古菌GC含量高达70%，需要80℃以上才能维持结构。

这是因为GC碱基配对有3个氢键，比AT碱基的2个更牢固。实验数据显示，当温度每升高1℃，GC含量每增加1%，DNA熔解温度（Tm值）就上升0.6℃左右。例如枯草芽孢杆菌（GC含量50%）在68℃开始变性，而嗜热古菌Thermococcus litoralis（GC含量65%）则需要82℃才能解链。变温分析通过逐步升温检测DNA解链点，高GC含量基因组就像穿厚棉袄的耐寒动物，需要更高温度才能脱掉保护层。就像煮鸡蛋要水开才能熟，GC多的DNA必须加热到特定温度才能释放里面的遗传信息。