柱层析后面有气泡会坏事的。气泡会破坏分离效果，让样品跑偏，还可能堵住柱子。比如你装柱子时没排净空气，跑完样后气泡会跟着样品乱跑，把目标物质和杂质混在一起。更糟的是气泡卡在柱子中间，像堵车一样让后续样品过不去。有次我实验时柱子中间卡了大气泡，结果后面的样品全没出柱子了。

为什么气泡会这么麻烦呢？柱子刚做好的时候内部全是空气，装柱子时如果没抽真空或者没摇晃均匀，空气就会残留在柱子中间。有研究显示柱子干燥后内部残留空气量能达到柱体积的3%-5%，装柱时每升柱子如果没排净超过5%的气泡，分离效率就会下降30%以上。比如我上次用300ml柱子，装完没抽真空，结果柱子中间有2cm高的气泡层，跑样时样品直接卡在气泡层下面出不来。保存不当也会出问题，柱子长时间不用没密封好，空气就会慢慢渗进去。装柱子时最好用抽真空泵抽2-3次，每次抽完摇晃30秒再继续装，这样气泡就能排干净了。