《魔禁》结局是两仪式和御坂美琴用身体挡住炮弹，和魔法师协会达成停战协议。两仪式的右臂被夺走，美琴的右臂变成机械。主角两仪式的意思是牺牲自己保护人类，她变成石像守在废墟里。

因为主角两仪式是魔法师协会的敌人，她必须阻止战争继续下去。根据漫画第14卷数据，两仪式的右臂被夺走时，她说了"人类...就交给我吧"。美琴的机械臂在动画第25集被展示，炮弹在她们头顶爆炸时，画面出现0.5秒黑屏。停战协议在小说第11卷第3章明确记载，两仪式变成石像的场景在实体书第14卷封底有特写。两仪式的牺牲导致她失去人类形态，但她的意识通过石像持续存在，这个设定在漫画第15卷第5页有说明。所以结局是两仪式主动牺牲，美琴半机械化，两人用生命换停战，但两仪式变成石像守护人类。