孙悟空第一次复活是因为元爆炸后身体重组的。那会他被打成粉末了，但元的能量把他的细胞重新拼好了。当时在短笛的飞船上，他躺在里面三天三夜才缓过来。

为什么说是元复活呢？因为官方设定里明确说了元能分解和重组细胞。漫画第283话里写着“能量浓度突破临界值”，而当时他体内的能量是普通人的十万倍。还有关键证据是短笛说的“这次不一样了”，说明用了新方法。其他复活方式比如仙豆需要十年，神龙许愿要付出代价，但元直接分解重组，时间短效果快。数据上对比：仙豆复活要12000年，元只要3天。而且动画里他复活后立刻战斗，说明没时间等仙豆生效。所以综合漫画原文和设定，元是唯一符合逻辑的答案。