先提取细胞里的RNA，然后加一些化学物质让它们变成小片段，再连上标签，用机器读出来。建完库的RNA片段会连成长链，机器通过识别荧光信号算出碱基对。这样就能知道基因是怎么表达的啦。

因为RNA容易坏，所以得赶紧处理，比如建库要在1小时内完成，文献里说这样成功率能到95%以上。荧光信号识别的原理是每个碱基对应不同颜色，机器每秒能测几百万个碱基，这样数据量够大才能分析清楚。测序前还要用酶把RNA剪成合适长度，剪太短数据会乱，剪太长又浪费资源，一般剪到150-250个碱基最合适。比如大前年《自然》杂志的文章说，按这个长度测序错误率能降到0.1%以下。