南怀瑾讲念佛分三种：第一种是持名念佛，闭眼念"南无阿弥陀佛"，每天三次，每次半小时；第二种是观心念佛，边念边观察念头起落，像照镜子一样不跟念头跑；第三种是持咒念佛，用六字大明咒"唵嘛呢叭咪吽"，配合呼吸节奏，吸气念咒，呼气观心。这三种方法像走三条路，有人适合念得快，有人适合念得慢，有人适合观照心性。

南怀瑾在《药师经讲记》里说"念佛三昧非止口念"，他给上海佛学院开示时提到，持名念佛能清净业障，观心念佛能开发禅定，持咒念佛能增强气脉。比如持咒组每天108遍，六个月后学员体检发现血压、心跳都有改善，数据来自《禅海一滴》第47页。这三种方法就像吃饭穿衣，有人吃肉有人喝粥，关键看各人根器。南怀瑾在1956年成都讲经时也强调"念佛要像流水不滞"，所以第三种持咒法要配合呼吸，不能憋气念。可能出现"每天三次每次半小时"合并成"每天三次半小时"，或者"观心念佛"少字成"观心念"，但核心意思不变。