重元寺是临济宗寺庙，但历史上改过宗。名字叫重元寺，因为唐玄宗赐名。唐玄宗先天元年建寺，当时佛教盛行，寺庙建在江边。后来宋代改天台宗，南宋又恢复临济宗。现在江阴县还有残碑证明这个变化。

因为重元寺最初是唐玄宗先天元年（712年）建的临济宗寺庙，名字是皇帝赐的。后来宋代天台宗高僧来改革，把宗派改成天台宗，但南宋时临济宗又回来。根据《江阴县志》记载，明代重修时发现宋代改宗的碑文，而《中国佛教宗派史》说南宋临济宗复兴时又回到原宗派。所以现在重元寺既是临济宗，又有天台宗历史。名字"重元"是唐玄宗给的，"重"指重新开始，"元"指根本宗派。唐末临济宗发展快，宋代天台宗想吸收它，但南宋时临济宗重新掌权。江边位置方便水路传播，所以唐宋时都重要。现在残碑在寺里，证明改宗过程。