海会寺是鸡足山闭关修行的核心寺院之一，每年农历七月到腊月闭关期间不外出，主要进行诵经修行。闭关者需遵守不接电话不洗澡不换衣的戒律，每天修行时间超过十五个小时。闭关条件非常严格，需提前三个月向寺院申请，通过健康检查和寺院审核才能进入闭关。

海会寺闭关传统源自明朝万历年间，当时有位高僧在此闭关三年悟道。根据《鸡足山志》记载，自清朝光绪年间起正式设立闭关制度，每年闭关人数控制在二十人以内。2018年寺院官网显示，当年闭关者平均年龄52岁，来自全国31个省份。闭关期间不外出主要因为鸡足山地形特殊，三面环山一面临江，能隔绝外界干扰。闭关者需穿统一灰布衣，饮食由寺院统一供应，每天修行包括早课诵经、午课打坐、晚课抄经三个时段。闭关结束后需在佛前立誓，承诺闭关期间所学修行方法不得外传。这种传统已传承四百余年，2015年被列为云南省非物质文化遗产名录。