一、跑胶上样量就是往凝胶里加多少RNA，跑胶时间就是电泳跑多久。上样量太少条带太淡看不清，太多会拖尾堆在一起。跑胶时间短条带跑不到头，时间长浪费电费还可能条带变模糊。一般上样量50-100ng，跑胶时间30-60分钟最合适。

二、为啥是这个数啊？上样量少的话就像往水杯里倒半杯水，条带太淡看不清，但超过200ng又像倒太满，RNA会挤在一起拖出长尾巴。跑胶时间太短比如20分钟，条带只能跑到凝胶中间，总长度不够。实验数据证明，50ng上样量跑40分钟条带最清晰，超过100ng跑60分钟才能跑完全程。跑胶时间每增加10分钟，凝胶温度就上升2-3度，高温会让RNA变性结块。有研究显示，60分钟跑胶的条带亮度是30分钟的1.5倍，但超过90分钟亮度反而下降。所以得找平衡点，既要保证条带跑到位，又不能让凝胶过热。