检测两种蛋白互作就是看它们能不能结合在一起。比如酵母双杂交，把两种蛋白分别装进酵母细胞，如果它们能结合，酵母就能生长；如果加抑制剂，酵母不生长，说明蛋白在起作用。还有免疫共沉淀，用抗体抓住一种蛋白，看看有没有第二种蛋白粘在上面。质谱分析能直接测出蛋白的混合物，看有没有两种蛋白在一块儿。CRISPR干扰的话，先让细胞表达一种蛋白，再干扰另一种蛋白的基因，如果细胞死得快，说明它们互相依存。

为什么这样检测？酵母双杂交最常用，因为酵母细胞自带"开关"，结合了就能激活生长。有研究显示，用这个方法检测酵母和人类蛋白互作，成功率达70%-80%。免疫共沉淀特异性强，但需要大量蛋白样品，成本高。质谱分析准确但步骤复杂，需要专业设备。CRISPR干扰成本低但耗时久，可能误判。比如2021年《Nature》论文用酵母双杂交找到2000多个互作对，证明其可靠性。不过这些方法各有优缺点，选哪个要看具体需求，比如研究阶段、预算和蛋白性质。实验前最好先查文献，看别人用过什么方法，别白干活。