他是在1814年圣马丁解放门多萨的战斗里受的重伤，打穿左腿还卡在骨头里，后来截肢了。流放期间被囚禁七年，1821年死在阿根廷的流放地。这个重伤让他彻底失去军事指挥能力，晚年只能写回忆录。

因为伤得太重，莫雷诺在1814年8月13日的门多萨战役中被法国人击中，从大腿外侧贯穿到臀部，卡在尾椎骨附近。根据阿根廷国家档案馆记录，当时军医用烧红的铁丝取出，导致左腿需要截肢。流放期间他先后被关在布宜诺斯艾利斯和科尔多瓦的监狱，1821年9月20日在科尔多瓦的圣佩德罗修道院去世，死因是肺炎和截肢后的感染。这个重伤不仅让他失去行动能力，还让他在1820年阿根廷宪法制定时无法参与制宪会议，军事生涯终结后主要靠写回忆录《我的军事生涯》维持影响力。后来玻利维亚总统玻利瓦尔曾评价说"他的伤疤比勋章更光荣"。