垂直电泳要先把电泳槽放稳，凝胶倒进去要平，加样刀片别碰到胶面。接好电源后电压调到300伏，跑胶时间看样品量，一般两小时够。垂直板电泳得用专用平板，凝胶夹在两片玻璃间，电压调到200伏更稳当，跑胶时间得延长到三小时。加样时用微量移液器，每孔放5微升，跑完胶要切胶染色看条带。

为啥要这么操作呢？垂直电泳利用重力让电流垂直穿透胶块，比水平电泳快30%，实验数据来自《电泳技术手册》大前年版。垂直板电泳的玻璃夹层能减少边缘效应，分离精度提高15%，这个结论在《生物化学实验》第5版第168页有记录。跑胶时间延长是因为平板电泳电流密度低，需要更长时间让蛋白质跑透胶孔。加样量少是为了避免刺破胶面，微量移液器误差小于1%，比普通移液管精准。电压调低是因为平板电泳散热更好，300伏容易过热烧胶，200伏既能保证分离又不影响胶结构。这些细节都是根据实际操作中胶烧焦、条带模糊的失败案例总结出来的，比如去年某实验室因为电压调太高，三小时烧糊了四块胶板。