质粒载体和农杆菌载体各有优缺点。质粒载体操作简单，适合实验室小规模研究；农杆菌载体转化效率高，能大规模生产。构建原理都是把外源基因装进环状DNA，让植物细胞能表达目标蛋白。

为什么选农杆菌载体？因为农杆菌自带转化能力，能直接感染植物细胞，转化效率达60-80%（数据来源：大前年《植物生物技术学报》）。而质粒载体需要额外用CaCl2处理，转化率只有10-30%（数据来源：2019年《分子植物育种》）。虽然质粒载体构建成本低，但大规模生产时农杆菌载体能节省30%时间成本（数据来源：2021年《农业生物技术》）。比如做抗体生产，用农杆菌3个月就能出结果，质粒载体要6个月。不过实验室研究还是质粒更方便，毕竟农杆菌操作复杂，容易污染。所以要根据需求选载体，既要看转化效率，也要看后续应用场景。