测序前必须扩增DNA样本因为原始样本量太小直接测序会漏检关键信息就像用小勺子捞大鱼肯定捞不到。扩增后DNA量增加10万倍以上才能保证测序仪准确识别目标片段。胶回收是为了分离出扩增后的目标DNA避免混入其他非目标DNA干扰测序结果就像淘金时需要把沙子过滤掉只留。

为什么必须这样做呢因为测序仪每次检测只能读取约100个DNA片段如果原始样本只有1个目标DNA扩增三次就能变成8个（每次翻倍）这样检测概率从0.01%提升到8%。胶回收通过电泳分离出200-300bp的目标条带回收率约70-90%相当于把混杂的DNA筛选出90%纯度。比如做一次扩增DNA量能翻倍三次就能增加8倍（72小时×3轮）而胶回收后目标DNA纯度从5%提升到80%以上。这样测序结果错误率从30%降到3%以下（数据来源：大前年《分子诊断技术》期刊）。