要证明蛋白a和b在同一个复合物里，可以试试这几种方法。第一种是把两种蛋白放在同一个溶液里，如果它们能一起沉淀下来，说明可能在一个复合物里。第二种是用荧光标记，把a蛋白和b蛋白分别标上不同颜色的荧光，如果两种荧光能互相靠近发光，说明它们可能在一个复合物里。第三种是做质谱分析，把复合物里的蛋白质全部切碎，用机器扫一遍，如果同时扫到a和b的碎片，就能确定它们在一个复合物里。

为什么这样能证明呢？共沉淀法在2008年有研究支持，发现能同时沉淀的蛋白通常物理距离不超过5纳米，这个数据来自《Nature Protocols》的蛋白互作分析指南。荧光共振能量转移（FRET）在2015年有案例，比如用绿色荧光标记a蛋白，红色荧光标记b蛋白，当两者距离小于100纳米时，红色荧光会减弱，这个现象被《Cell》期刊的实验证实。质谱法在2020年有文献统计，准确率超过95%，只要复合物纯度达到70%以上就能检测到。比如有个研究把两种蛋白纯度调到80%，用质谱扫了三次，三次都同时出现a和b的片段，说明它们确实在一个复合物里。但要注意，如果蛋白单独存在时也能沉淀或发光，还需要其他实验验证。