要先用显微镜的荧光模式看发光样本。先把样本放在载玻片上，用紫外线或蓝光照射，样本里的荧光物质会变亮。然后换用绿色或红色滤镜，通过目镜或摄像头看发光的位置和颜色。如果样本没亮，可能是荧光物质没激活，得换波长或补光。

因为荧光显微镜是专门看发光物质的仪器，它的工作原理是先给样本打特定波长的光，样本里的荧光分子吸收光后就会发另一种颜色的光。比如给细胞打450纳米紫外线，细胞里的荧光标记物会发500-600纳米的绿光。这样就能区分不同标记的细胞结构，比如前年《细胞生物学杂志》的研究显示，这种技术能让细胞器观察精度达到0.5微米。所以必须用对应波长的激发光和接收光，就像用对色眼镜看彩色图片一样。而且样本必须固定在载玻片上，否则移动太快会看不清发光点。