嵌入染料在DNA复制时插进去了，会卡在碱基对中间。DNA复制机器得绕开这个染料，结果经常多加少加碱基，或者把顺序搞乱，这样细胞分裂时就可能出现错误密码子，让细胞变成坏细胞。

因为嵌入染料是人工合成的化学物质，它得先混进DNA溶液里。当DNA复制酶（这个机器专门负责复制DNA）遇到染料的时候，染料会像卡在齿轮中间的硬块一样挡住复制路径。这时候复制酶有两种选择：要么绕开染料继续工作，要么直接放弃复制。如果选择绕开，它可能漏掉一个碱基或者多加一个碱基，这样就会产生移码突变。比如有个实验用溴化乙锭处理细菌，发现30%的细菌DNA会出现3个碱基的移码错误。如果复制酶放弃复制，那这段DNA就会变成断裂的，细胞得启动修复机制，但修复过程也可能出错。还有个关键点是，染料浓度越高，突变率越高，但浓度太高还会直接杀死细胞。所以科学家现在都用低浓度的嵌入染料来做基因编辑，既能引发突变，又不会让细胞全死掉。