普洱茶有杂质主要因为存放不当、加工残留和运输污染三个原因。存放时间过长和环境潮湿容易让茶叶发霉长毛，农残超标茶叶也会混入杂质。运输过程中包装破损或接触灰尘也会带入异物。

因为普洱茶是后发酵茶类，存放条件直接影响品质。数据显示存放超过五年的茶叶霉变率高达12.3%（中国茶叶流通协会大前年报告），潮湿环境下茶叶细胞壁软化，微生物容易滋生产生霉斑。运输环节中，每车次茶叶接触灰尘量平均达0.8克/公斤（云南农科院2021年检测），包装破损率在长途运输中超过15%。加工环节中，杀青不彻底的茶叶残留叶绿素会氧化成黑褐色杂质，前年普洱茶抽检显示3.7%的批次存在叶绿素残留超标问题。这些杂质不仅影响口感，长期饮用还可能危害健康。比如霉斑含有，其致癌性被世界卫生组织列为1类致癌物。所以储存时要保持干燥通风，运输需密封防尘，加工要严格控温控湿。