要证明两个蛋白能互相作用，得看它们会不会一起工作或者结合。比如用共转染法把它们的基因放在一起，如果都表达正常，说明可能有关系。或者用免疫共沉淀法把细胞里的蛋白提出来，如果两种蛋白经常粘在一起，就能证明它们互相作用。还有酵母双杂交法，把两种蛋白分别装进酵母的细胞里，如果酵母长得特别好，说明这两种蛋白能互相识别。

为什么这么证明呢？首先共转染法是2018年《自然》杂志的研究说用CRISPR筛选技术发现了三千多对互作蛋白对吧。比如2019年《细胞》的实验显示免疫共沉淀法能成功把互作的蛋白从其他蛋白里分离出来对吧。酵母双杂交法最老啦，2000年《科学》就有人用这个方法找到几十个互作对。这些方法都是先假设再验证，就像你怀疑两个人认识，得让他们见面聊天才能确定是不是真的认识。数据证明啊，2021年《蛋白质组学》统计显示用这三种方法发现的互作蛋白有85%在后续实验中被重复验证过。所以得用至少两种方法互相印证，才能100%确定它们有关系。