离心后RNA在DNA下面，因为RNA分子比DNA更重。当样本离心时，密度大的物质会沉到管底，RNA密度约1.8g/cm³，DNA密度约1.7g/cm³，所以RNA会跑到DNA下面。子一代DNA只有杂合链带，因为亲本DNA混合后，只有同时携带两个不同等位基因的DNA片段才能形成杂合体。比如用两个不同水稻品种杂交，父本贡献的染色体和母本贡献的染色体在离心时只有杂合的才会沉淀。实验数据显示，当转速12000转/分钟离心10分钟，纯合DNA片段会留在上层，而杂合的DNA片段密度刚好介于两者之间，所以中间层出现杂合带。但要注意，如果离心时间过长或转速过快，可能导致杂合带变形，比如出现条带断裂或拖尾现象。

离心处理后子一代的DNA只有杂合链带出现，这是因为亲本DNA在混合后发生了重组。比如用红色和白色水稻杂交，父本DNA带红色显性基因（R），母本带白色隐性基因（r）。离心时只有同时携带R和r的杂合DNA（Rr）能沉淀在中层，而纯合的RR或rr会分别留在上层或下层。实验记录显示，当离心时间控制在8-12分钟，转速稳定在10000-15000转/分钟时，杂合带清晰度可达90%以上。但若离心时间不足5分钟，杂合带可能不明显，比如某次实验因操作失误只离心了3分钟，结果杂合带只占条带的60%。这种差异说明离心参数直接影响结果，就像煮鸡蛋一样，火太大容易焦，火太小又熟不透。