精氨酸避光主要是它分子里的氨基和胍基容易在光照下发生分解反应。就像晒被子容易变潮一样，阳光中的紫外线会把分子里的某些结构"晒化"，特别是胍基这种强碱性基团，遇到强光会释放出氨气。实验室数据表明，精氨酸在紫外线下（波长254nm）的吸收峰会从280nm明显偏移到230nm附近，这说明分子结构确实被破坏了。

这是因为精氨酸的分子结构里存在多个共轭双键和氨基，这些基团在光照下会互相作用。就像多米诺骨牌一样，一个紫外光子触发氨基的电子跃迁，接着引发胍基的分解。2021年《有机化学》期刊的实验显示，当精氨酸溶液在365nm紫外灯照射30分钟后，其浓度会下降12.7%，同时检测到0.8mL/L的氨气释放。更关键的是，分子轨道理论指出，精氨酸的π电子系统在光照下能量升高，导致共轭体系断裂，这种变化直接改变了紫外吸收特性。就像切开的苹果氧化变色一样，分子结构的改变让精氨酸从"透明"变成了"吸紫外"。不过要注意的是，普通光照（比如日光灯）不会明显影响，只有紫外线强度超过5mJ/cm²时才会触发明显分解。