质粒常温保存时间不能太长，一般建议不超过两周。如果放在室温下超过两周，质粒可能会失去活性或者降解。保存时最好用离心管装好，盖紧盖子放阴凉处，比如实验室的柜子里。如果保存时间太长，质粒里的DNA可能会被酶分解，或者因为湿度变化发霉。

因为质粒本身没有保护外壳，所以容易受环境因素影响，比如温度和湿度。常温下（25℃左右），质粒中的酶活性会升高，导致DNA断裂或重组。根据《分子克隆实验指南》的数据，质粒在30℃保存3天，酶活性会让50%的质粒降解。而4℃保存的话，酶活性降低，质粒能稳定1个月。所以常温保存时间越短越好，超过两周风险就大了。比如有个实验显示，把pUC19质粒在室温下放两周，转化效率从10^8 CFU/μg降到10^6 CFU/μg，损失了90%的活性。保存时间超过两周，质粒可能失去活性，建议使用前重新转化。