要测脂肪酶的分子量，先得把酶提纯出来。把脂肪酶从混合物里分离出来后，用SDS-PAGE电泳法看条带位置。电泳是把蛋白质按分子量大小排成条带的，条带越靠近阴极分子量越小。然后拿标准蛋白对照，比如看见条带和50kDa标准蛋白一样高，那这个酶的分子量就是50kDa左右。用质谱法测更准，把酶样本电离后分析质谱图，直接得到精确分子量数值。

为什么这样做？因为蛋白质分子量越大，在电泳时移动越慢。比如实验数据显示，分子量30kDa的酶条带在电泳槽跑20分钟就到底部，而100kDa的酶要跑50分钟。质谱法测的是酶分子离子的质荷比，比如某脂肪酶质谱显示m/z 5800，换算成分子量就是58kDa。但电泳法受样本浓度影响大，浓度高条带会变粗，所以先用电泳粗略判断，再用质谱精确验证。实际操作中，电泳跑完条带后要马上拍照记录，过夜条带会变模糊。比如某次实验，电泳条带24小时后出现拖尾，导致误判分子量，后来改用预染蛋白 marker 后准确率提升到95%。