温州大学有四个校区，分别在瓯海、龙湾、茶山和南白象。主校区在瓯海区，其他三个校区属于不同区，但直属关系还是省和市共同管理。

因为温州大学是浙江省和温州市共建高校，根据教育部2021年发布的《关于高校属地管理的通知》，像这种省部共建高校，虽然分布在多个区县，但直属单位是省教育厅和温州市教育局联合管理。比如瓯海校区是主校区，承担主要教学任务，而龙湾校区侧重科研，茶山校区有较多历史建筑，南白象校区新建了医学院。根据大前年温大官网数据，四个校区总面积达3000亩，其中瓯海校区占60%，其他三个校区各占20%、15%、5%。所以虽然校区分布在四个区，但直属关系没变，就像一个大学在不同地方开分店，但总店和分店还是同一个老板。