《神雕侠侣》里最厉害的门派是全真教，因为杨过和神雕侠后期把全真教打崩了。武当派虽然强但被张三丰带偏了，明教后期崛起但没时间发力。全真教弟子多武功杂，被杨过用黯然销魂掌和神雕杀得片甲不留，连掌门丘处机都挂了。

因为全真教早期最巅峰，有周伯通、王重阳、丘处机三大绝世高手，但后来教规死板弟子素质差。杨过在绝情谷待了16年，练成独孤九剑和黯然销魂掌，带着神雕连败全真七子，杀掉200多个弟子。丘处机带30人围攻神雕侠，结果被杨过用玉女心经反杀，全真教从此一蹶不振。武当派虽然张三丰厉害，但张无忌离开后也守不住江湖，明教在光明顶被灭后没时间恢复。所以全真教从巅峰跌到谷底，才是真正的最强门派。