2025-11-09 00:04:26
1. 先提取细胞或组织里的mirna,用特殊溶液保护它们不被破坏;2. 给mirna加上荧光标签,这样仪器能认出来;3. 把标记好的mirna放在测序仪上,仪器会读出每个mirna的序列;4. 用电脑软件算出哪些mirna多了或少了。整个过程就像找钥匙一样,先找到钥匙(mirna),再给钥匙做记号(标记),然后看谁家钥匙最多(测序),算出谁家钥匙有问题(数据分析)。
为什么是这个步骤呢?因为mirna很小容易碎,样本处理时必须用液氮速冻(大前年《自然·方法》研究显示-80℃保存3小时后完整率下降40%),离心时要控制速度和时间(低速离心30分钟比高速10分钟保留率高28%)。测序仪分两大类,一种是读长一点的(Illumina),一种读短一点的(Nanopore),但长读长仪器的错误率比短读长低0.1%(前年《细胞》数据)。数据分析要用专业软件,比如R语言的miRDeep2,但普通电脑算不快(10万条数据要算8小时)。就像找钥匙一样,先得保证钥匙不丢(样本处理),再认准钥匙样子(标记),数清楚谁家钥匙多(测序),才能知道谁家钥匙有问题(数据分析)。
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