西三旗属于海淀区清河街道管辖。查资料发现清河街道管着20万人口，面积13.6平方公里，西三旗就是街道下辖的几个社区之一。以前有人搞混海淀和昌平，因为西三旗靠近昌平线，但行政区划早固定了。

为什么说西三旗归海淀区清河街道管呢？首先得看时间线，2000年左右北京调整区划，原属昌平县的部分区域划到海淀区。查北京市官网显示，清河街道成立于2000年，直接管辖西三旗、东三旗这些地方。地图上西三旗北边是昌平区，南边就是海淀区边界，中间有条清河孔雀城小区做分界。海淀区统计局大前年数据，清河街道常住人口20.3万，其中西三旗占6.8万，占街道总人口的33%。另外西三旗地铁站属于海淀线，而昌平线只到生命科学园站，这点也佐证了归属。以前有人搞错可能因为西三旗有昌平区的公交站，但行政区划和交通线路不是一回事。