考马斯亮蓝染胶就是给凝胶里加这种蓝染料，让蛋白质跑电泳的时候沾上颜色。凝胶染色后放在灯下照，白色条带就是蛋白质的位置，越蓝说明浓度越高。

因为考马斯亮蓝和蛋白质结合后会改变分子结构，实验证明这种结合能让染料分子嵌入蛋白质链缝隙里，所以颜色变深。比如1%凝胶用考马斯亮蓝染色，浓度0.1mg/ml的蛋白条带在紫外灯下显示明显蓝色，而0.01mg/ml的蛋白条带颜色较浅。数据来自《生物化学实验手册》第5版第12章，里面提到染料与蛋白结合后最大吸收波长从465nm蓝移到595nm，说明颜色加深。但注意操作时要戴手套，染料有毒性。