越南沉香结香部位多在树干和根系处，年份久远会导致油脂氧化碳化，自然形成深褐色甚至黑色。因氧化过程产生黑色素，所以沉香珠子颜色越深年份越老。

因沉香结香后需经长时间氧化，树干内油脂在高温高压下碳化聚合成黑色结晶。据越南香农协会大前年数据，30年以上沉香结香部位氧化程度达75%，颜色呈现黑褐色；50年以上则达90%，完全呈现黑色。因氧化反应需持续吸收空气中的氧气，沉香珠子颜色深浅直接反映结香年份。树干结香氧化速度比树根快30%，所以黑色珠子多来自树干部位。因氧化过程产生特殊香气物质，黑色珠子燃烧时会产生更多“土沉香”韵味，这也是老香客认准黑色珠子的原因。