配胶要先用缓冲液调浓度，一般1.5%到2%的琼脂糖胶最合适。跑胶时间大概2-3小时，电压调到5-6伏每厘米。看结果要看有没有清晰的条带，中间那条最粗的就是完整RNA，两边有条带说明降解了。跑胶太慢胶会变硬，电压太高条带会跑太偏。

为什么这么配胶呢？因为琼脂糖浓度和电压直接影响跑胶效果。比如2%胶能分开200个碱基的差距，1.5%胶只能分开100个。实验数据显示电压每升0.5伏，跑胶时间就减少15分钟。胶浓度太低条带会重叠，比如1%胶里200和250碱基的条带会混在一起。跑胶时间超过3小时胶会变脆，容易断裂RNA。电压超过6伏每厘米，2000碱基的条带会跑出胶外。所以选1.5-2%胶，5-6伏电压，跑2-3小时最稳当。跑完胶如果有三条明显条带，说明RNA提取合格；如果只有一条带在中间，说明降解严重得重做。跑胶时间不够的话条带会太宽，电压太高条带会跑散，胶浓度不对条带会重叠。比如用2%胶跑2.5小时，2000碱基的条带位置大概在中间偏左，降解条带会在左边出现模糊的小波浪纹。