荧光二抗就是给蛋白标记荧光染料的抗体，普通二抗是给蛋白标记普通酶或化学物质的抗体。比如用荧光二抗的话，在显微镜下能看到蛋白发光；用普通二抗的话，需要在化学反应里加底物才能显色。荧光二抗适合看活细胞里的蛋白动态，普通二抗适合测蛋白含量。

荧光二抗和普通二抗之所以有区别，主要因为标记物不同导致用途不同。荧光二抗的荧光染料能被激光激发发光，比如常用的Cy5、FITC这些染料，在波长450-650纳米之间有强发射光谱（1）。普通二抗的标记物通常是辣根过氧化物酶（HRP）或碱性磷酸酶（AP），它们需要结合底物（比如TMB或BCIP）才能产生颜色变化（2）。实验数据显示，荧光二抗的检测灵敏度可达0.1-1 ng/μL，而普通二抗的灵敏度一般在10-100 ng/μL之间（3）。荧光二抗的成像速度更快，通常几分钟就能完成，而普通二抗需要孵育几十分钟甚至更久。不过普通二抗成本低，适合大量样本检测，而荧光二抗设备贵，但能同时检测多个荧光通道（4）。比如做Western Blot用普通二抗测蛋白量，做活细胞成像用荧光二抗看蛋白定位，这就是它们的核心区别。