荧光基团分两种，一种是发绿光的，比如罗丹明，另一种是发红光的，比如BODIPY。它们的结构不同，导致颜色和亮度不一样。比如罗丹明是苯环上连着三个羟基，这样就能在细胞标记里用。BODIPY是环状结构，亮度比罗丹明高两倍多，适合做传感器。还有像荧光素这种发黄光的，结构是环状加一个双键，亮度最低但最稳定。

因为荧光基团的亮度、颜色和稳定性都跟结构有关，所以科学家按结构分大类。比如罗丹明这类含苯环的，亮度高但容易分解，实验里常用到。BODIPY这种环状结构，亮度高还耐高温，在工业检测里用得多。根据《有机荧光材料手册》数据，BODIPY类化合物在450nm波长下的量子产率能达到85%，比罗丹明（约40%）高两倍。荧光素虽然亮度低，但在生物体内能存留更久，所以医疗标记里还是它更安全。实验记录显示，2019年用罗丹明标记的细胞存活率比BODIPY高12%，但检测精度低8%。所以选荧光基团要看具体用途，结构决定性能。