保存温度要-20度左右，冷冻能锁住蛋白结构不让它变质。荧光颜色是红色，因为蛋白里的共轭发色团在低温下更稳定，发出来的光波长在610到630纳米之间。要是放常温或者高温，蛋白容易变皱，发色团断开，荧光就变暗或者发黄了。低温保存时，荧光颜色最鲜艳，像红宝石一样亮堂堂的。

为什么保存温度要-20度呢？低温能降低分子运动速度，减少蛋白质变性。藻红蛋白的半衰期在-20℃能存半年，常温下三天就失活。荧光颜色和发色团结构有关，实验数据显示，温度每升高10度，荧光强度下降15%。比如4℃保存时，荧光波长还是620纳米左右，但亮度只有-20℃时的四成。冷冻还能防酶解，藻红蛋白里的酶在低温下活性降到零，不会分解蛋白。要是保存温度超过-10度，荧光颜色会慢慢变淡，像被稀释了一样。低温保存时，荧光颜色最稳当，实验误差能控制在5%以内。