跑蛋白实验一般用80-120伏电压跑胶，电压低时胶条跑得慢但蛋白条带分得细，电压高时跑得快但容易把大分子压碎。比如用120伏跑1.5小时，小分子蛋白能分开得清；要是用60伏跑3小时，条带可能重叠成一片。时间选得对才能让蛋白在凝胶里慢慢迁移到位。

为什么电压不能随便调呢？因为电压太高就像用高压锅煮东西，大分子蛋白还没跑到位就被压成糊状了。根据实验手册数据，当电压超过140伏时，超过50千道尔顿的蛋白迁移率会下降30%以上。比如用90伏跑2小时，20千道尔顿的蛋白能跑到凝胶中间位置，而用130伏跑同样的时间，同样的蛋白只能跑到离底部10毫米的地方。所以得根据蛋白分子量大小来定电压，小分子蛋白可以适当调高电压，大分子蛋白就得降低电压延长跑时间。这样既保证蛋白条带分开清楚，又不会让它们在凝胶里被压变形。