转录组测序要花不少钱样品数量也得看测序深度比如做全基因组测序一个样本可能要花五千到两万块具体价格取决于测序平台和深度现在市面常见的是Illumina NovaSeq和Oxford Nanopore这两种平台价格差挺大比如 NovaSeq单组学测序每GB约2000元而 Nanopore每GB要贵三倍多所以同样的十万个样本测序有的实验室报价三万有的报价八万

为什么是这个答案呢咱们得拆开来看首先测序成本和样品数量是两码事样品数量主要看测序深度比如做单倍型测序得二十个样本做单细胞测序得五十到一百个样本像做肌肉组织样本得取一厘米见方的组织块而肝脏组织得取三厘米见方的样本这些样品量差异跟组织类型和测序目的直接相关其次价格差异来自平台差异比如 NovaSeq的测序通量是 NovaSeq 6000是600万通量每跑一次测序能出十万个样本而 Nanopore的测序通量是百万级但单次测序能出十万到二十万个样本所以同样的十万个样本测序 NovaSeq报价三万 Nanopore报价八万这差距跟测序通量单价有关联咱们实验室去年做过对比数据单组学测序 NovaSeq单价0.2元/GB Nanopore是0.6元/GB但单细胞测序 Nanopore单价反而低0.3元/GB这跟测序技术特性有关联所以选测序方案得综合考虑样品量测序深度和平台单价这三点因素