翡翠里的黑色主要是矿物杂质造成的。这些黑色物质可能来自外界碰撞带入的辉石角闪石等硬质矿物，也可能在翡翠形成过程中因高温高压导致内部结构缺陷产生。比如缅甸老坑翡翠的黑色通常出现在裂隙处，是后期侵入的辉石结晶造成的。

矿物杂质形成与翡翠形成环境密切相关。当翡翠原石在地下经历2-3亿年的高压高温时，如果岩浆活动频繁，辉石角闪石等杂质就会随熔岩渗入裂隙。数据显示缅甸翡翠带黑点区域辉石含量达5%-8%，角闪石含量约3%-5%。这些杂质在冷却过程中形成定向排列，导致黑色块状分布。比如勐海料中黑色杂质多呈片状分布，而危料则以点状黑色为主。后期地质运动如板块碰撞会让这些矿物再次活动，造成翡翠表面黑状纹路。实验证实用强光手电照射，黑色杂质区域会呈现明显反光差异，折射率比正常翡翠低0.02-0.03。这种矿物杂质的存在直接影响翡翠的透明度和价格，纯度高的翡翠黑色杂质含量应低于0.5%。