知府的上面是总督或巡抚，再往上就是中央的尚书，是皇帝。比如清朝的时候，知府管一个省的几个府，总督管一整个省，巡抚也管一整个省，但总督管的是特别重要的省。尚书在京城工作，管全国的大事，皇帝下面还有大学士，地位比尚书高。

因为清朝的官职体系是省-府-县三级，总督和巡抚是省级最高长官，负责军事和民政。根据《清史稿》记载，总督有五个，分别管两江、两广、四川、陕甘、闽浙，每个总督管辖范围比巡抚大。巡抚管一省，比如直隶省的巡抚管北京周边。尚书属于六部之首，比如礼部尚书管教育祭祀，兵部尚书管军队。皇帝是最高统治者，但实际权力有时被大学士和军机处分走。比如康熙年间，大学士明珠权力很大，能直接向皇帝建议人事任免。这种层级划分从明朝延续到清朝，到民国才改成省-县两级。