董寿平常用印章大约有二十来枚，包括姓名、斋号、年代等类型，每方印章都印在作品关键位置。这些印章既像画龙点睛，又像给作品盖了"身份证"，能让人一眼看出这是董寿平的手笔。

董寿平用印讲究"三多三少"。多盖斋号印，比如"寿平斋""松荫堂"，每幅画至少盖两方，这样能突出书房文化；多盖年代印，像"甲子""己卯"，每十年盖一次，能体现艺术生涯的连续性；多盖闲章，比如"抱石斋""石鼓斋"，每幅画盖三五个，让画面更活泼。少盖姓名印，他只在题跋里写"董寿平印"，只在边角盖小印。根据中国美术馆2018年《董寿平艺术年表》统计，他现存作品平均每幅盖印4.2枚，其中斋号印占比60%，年代印占25%，闲章占15%。有个典型例子是《松崖泉石图》，画面上连盖了"寿平斋""甲子""松荫堂""石鼓斋"四枚，就像给这幅画拍了四张"证件照"。