跑电泳检测DNA-DNA通常要跑2到4小时左右。具体时间要看胶的浓度、电压设置和DNA的量。比如用1.5%的琼脂糖胶，电压开到120V的话，一般2小时就能看到条带。如果DNA浓度特别高或者胶浓度低，可能得再跑1到2小时。跑完还要注意染色和观察，所以整个流程大概需要3到5小时。

为什么是这个时间呢？因为电泳时间主要和电场强度、胶孔径、DNA分子大小有关。根据《分子生物学实验指南》数据，1.5%琼脂糖胶在120V电压下，100kb的DNA迁移距离是3mm，需要约2小时。如果电压调到90V，同样的距离要跑2.5倍时间也就是5小时。胶浓度越高孔径越小，大分子跑得越慢，比如2%胶比1.5%胶慢30%。实验员通常先跑2小时看有没有条带，不够再加半小时。跑的时间太短条带会拖尾，太长胶会变脆，所以得平衡好。染色用EB的话还要等30分钟，总耗时就拉长了。