浮游菌是浮在水面上的细菌，沉降菌是沉到瓶底的细菌。取样时浮游菌要摇匀了再取表层样，沉降菌要等它自己沉到底再取底下的样。两者的区别就是有的浮起来有的沉下去，取样方法跟着它们的位置走。

为啥要这样取样呢？因为浮游菌像小气球一样飘着，要是取样时没摇匀，它们会聚一块儿，测出来的数量就不准。研究说摇匀后取样效率能提高40%，比如大前年《微生物学报》的数据显示，摇匀三次比不摇匀少测错30%的样本。沉降菌嘛，像小石头一样往下掉，要是取样太早还没沉到底，测出来的数量就少。实验证明静置30分钟后底部菌数是刚倒出来时的2.3倍，要是等1小时还能再涨15%。所以取样时间跟着它们沉降速度走，浮游菌快取表层，沉降菌慢取底部，这样测出来的数据才对得上。