液质图谱不是质谱图，而是液相色谱和质谱连用的结果。液相色谱负责把混合物分开，质谱负责测每个分开的成分。比如喝咖啡时，色谱像筛子把不同物质筛出来，质谱像放大镜看筛出来的东西具体是什么。图谱上左边是色谱峰，右边是质谱碎片，两者搭配才能知道物质种类和含量。

其实这是两个仪器接力工作。液相色谱分离效率高，比如能分离出10种以上成分，但单独看成分结构不清楚。质谱检测限低至0.1纳克，能测出0.1%的微量物质。比如测药物有效期，色谱分离出有效成分，质谱通过m/z 150和碎片峰确认是阿司匹林。实验数据表明，液相色谱保留时间误差小于2%，质谱质量精度达0.001 Da，两者结合误差总和小于0.5%。但有人会误以为色谱图就是质谱图，就像把火车头和车厢当一套车一样。其实液相色谱图显示分离情况，质谱图显示分子结构，必须同时看才能分析清楚。比如测农药残留，色谱峰位置变化说明降解了，质谱碎片变化说明残留物结构了。有人把色谱峰当质谱峰，结果算错含量，比如某次检测把保留时间2分钟的峰当质谱峰，实际是未分解的母体农药，导致报告错误。所以正确做法是先看色谱峰位置，再看对应质谱图确认。