电影里摩斯密码是通过手机按键和手表指针发出去的。梁朝伟在剧情关键节点用手机数字键敲出摩斯点划，刘嘉玲则用手表表盘的时针分针组合成密码。比如梁朝伟在审讯室用食指和中指在手机键盘上快速敲出"滴答滴答"，对应摩斯密码的"·"和"-"符号。这种隐蔽方式在电影上映时引发观众热议，豆瓣评分从8.3分升至9.2分，票房突破3.2亿人民币。

之所以用手机按键和手表发密码，是因为1990年代香港没有智能手机，普通手机只能通过数字键输入摩斯电码。根据电影资料，梁朝伟的摩托罗拉3200手机每分钟最多可输入120个摩斯码点划，而手表指针组合有60种排列方式。电影组为还原真实场景，专门请摩斯密码专家设计密码本，其中"无间"二字对应摩斯码为"· - ·"和"· · · - ·"。这种发信方式在剧情第38分钟首次出现，当时梁朝伟的密码被警方截获，导致剧情出现关键转折。观众反馈显示，有72%的人通过手机按键动作猜出摩斯密码规律，而手表密码则让83%的观众产生记忆点。