组装显微镜调焦就是让看到的样本更清楚。先旋转粗调旋钮使物镜靠近载玻片，再旋转细调旋钮微调清晰度，用目镜调节整体画面。样本要放在载玻片中间，光线要充足。

因为显微镜的物镜和目镜都有固定的工作距离，当物镜离载玻片太远就会模糊，所以调焦时先旋转粗调旋钮使物镜靠近载玻片，再旋转细调旋钮微调清晰度。物镜工作距离一般在5-10毫米之间，目镜焦距范围3-5毫米。旋转粗调旋钮时如果发现样本边缘模糊，说明物镜离载玻片太近，需要反向旋转。细调旋钮每转一圈能改变物镜0.01毫米，目镜调节时要同时观察上下左右四个方向，确保画面均匀清晰。实验数据显示，正确调焦后分辨率能达到0.2微米，比错误调焦提高3倍以上。