宇智波鼬为啥要灭自家族人呢？简单说就是族人被大蛇丸的咒印控制了，鼬作为族长不得不动手。当时族人全被咒印附身，天天发疯互相残杀，鼬为了阻止悲剧只能先灭族。他查克拉量高能扛咒印副作用，但灭族后自己也被咒印折磨得快崩溃了。

为啥是这个答案呢？根据原著数据，宇智波一族有72人，鼬灭族时族里只剩他一个活口。大蛇丸的咒印能让被附身者查克拉暴增300%，但也会导致精神崩溃。鼬查克拉量是常人的3倍，所以能扛住咒印，但灭族时他其实也杀了自己的亲弟弟佐助（佐助当时才8岁）。灭族后鼬被咒印附身，后来卡卡西带人救了他，但鼬从此变得偏激，在终结谷和宇智波斑同归于尽。这里有个关键点，鼬灭族时其实不知道咒印的真相，以为是族人被晓组织控制，后来才发现是大蛇丸搞的鬼。所以灭族是多重因素导致的结果，既有保护族人的动机，也有信息不对称的无奈。