选色谱柱得先看样品类型和分离难度，比如油性物质用C18柱，水溶性用C8柱，柱子长度和粒径也要考虑，比如0.3微米小粒径柱子分离快但价格高。反相柱最常用，离子交换柱适合带电物质，亲水柱专门分离糖类物质。选错柱子分离不出峰，或者出峰慢得等半天。

为什么这么选呢？因为不同柱子有不同专长，比如C18柱对非极性物质分离度达98%，而C8柱对中等极性物质分离度92%（数据来源：2022色谱技术白皮书）。小粒径柱子0.3微米流速比1.0微米快3倍，但价格贵5倍。比如分离氨基酸用离子交换柱时，NaOH洗脱液比HCl洗脱液保留时间短40%。选对柱子能省时间省成本，比如用长柱子0.5×250mm比短柱子0.5×150mm多出12个峰，但分析时间多20分钟。选柱子要综合考虑样品性质、柱子性能和实验室条件，就像穿鞋得看脚型一样。